İstanbul Fatih ilcesi, Vatan Caddesi ile Oğuz Han Caddesi nin kesiştiği noktada bulunan bu medrese Kanuni Sultan Suleyman 15201566 tarafından, babası Yavuz Sultan Selim 15121520 anısına yaptırılmıştır
Medresenin bulunduğu alan cevre duzenlemeleri ve onunde acılan Vatan Caddesi nedeni ile cukurda kalmıştır Mimar Sinanın eserlerinin listesini veren TezkiretulEbniye, Tezkiretul Bunyan ve Tuhfetul Mimarine gore Mimar Sinan tarafından yaptırılmıştır
Yapım tarihini belirten bir kitabesi bulunmamaktadır Ancak kaynaklarda medresenin 15481549 yıllarında yaptırıldığı belirtilmektedir Medresenin dershanesi 15621563 yılında bir minare ve minber eklenerek mescide cevrilmiştir
Medrese kesme kofeki taşından ve yer yer tuğladan yapılmış olup, bir duvar icerisine alınmıştır Bu duvarın Aksaraya yonelik cephesine anıtsal bir giriş, yanına da kitabesi bulunmayan bir ceşme eklenmiştir Uzeri kubbe ile ortulu olan bu girişten sonra ikinci bir kapı ile avluya gecilmektedir
Avlunun ortasında bulunan şadırvan gunumuze ulaşamamıştır Medrese hucrelerinin onundeki taş ayaklar uzerine oturtulmuş kubbeli kasnaklı revaklar yuvarlak kemerlerle birbirleri ile bağlantılıdır Kare planlı olan hucrelerin uzerleri pandantifli kubbelerle ortulmuştur Bu hucreler revaklara birer kapı ile acılmaktadır Ayrıca bunların dışarıya ikisi altta biri ustte olmak uzere ucer penceresi vardır İclerinde bulunan ocakların yaşmakları gunumuze ulaşamamıştır Ocakların uzerindeki dortgen ve altıgen prizma şeklindeki bacaları kurşunla ortulu yuksek kulahlar şeklindedir
Medresenin dershanesi guneybatı yonunde olup, avlunun simetrik ekseninden yana kaydırılmıştır Yalnızca revak kısmı avlu icerisinde olup, dershanenin ana kutlesi dışarıya taşırılmıştır Dershane giriş revakı kırma catı ile ortuludur Kare planlı olan dershanenin girişine mukarnaslı bir mihrap yerleştirilmiştir Dort cephesinde iki alt, iki de ust penceresi bulunmaktadır Dershanenin uzeri pandantifli bir kubbe ile ortulmuş olup, kubbeye geciş tromplarla sağlanmıştır İcerisinde ilk yapılışına ait bezemesi gunumuze ulaşamamıştır
Medrese 1914 yılından sonra cevresindeki yangından zarar gormuş, 1918de aşhane olarak kullanılmış ve aynı yıl yeni bir yangınla da harap olmuştur Vatan Caddesinin acılması sırasında ortaya cıkan medrese 19581962 yılları arasında Vakıflar Genel Mudurluğu tarafından restore edilmiştir Bundan sonra İstanbul Vakıflar Baş Mudurluğunun yazma eserler ve halılardan oluşan teberrukat deposu olarak kullanılmıştır
1968 yılında da medrese Vakıflar Genel Mudurluğu tarafından İstanbul Vakıflar Baş Muduru İhsan Erzinin cabaları ile Yazı Sanatları Muzesine donuşturulmuştur Bu muzenin Beyazıt Kulliyesine taşınmasından sonra da 1994 yılından itibaren Sağlık Vakfına bağlı Şadiye Hatun Teşhis Kliniği olarak kullanılmaktadır